AMI

Создание AMI:
На инстанс в каталог /mnt заливаем ключ и сертификат, можно воспользоваться scp.
Снимаем образ:
# ec2-bundle-vol -p myAMI -k /mnt/private_key -c /mnt/certificate -u xxxx-xxxx-xxxx

ключ обычно имеет вид pk-xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx.pem
сертификат - cert-xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx.pem
-u - идентификатор юзера
-p - название амишки

Заливка на S3:
# ec2-upload-bundle -b accessd -m myAMI.manifest.xml -a access_key -s secret_key
-b - папка на S3
access_key и secret_key можно посмотреть в разделе Security в информации по аккаунту.

Напоследок регистрируем AMI в консольке aws, указав путь, сформированный в предыдущей команде.